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2009年全國政府性基金收入18335.04億元，全國政府性基金支出16118.79億元。其中：
中央政府性基金收入2507.67億元，完成預算的108.8%，增加0.82億元，超預算主要是新增建設用地有償使用費、彩票公益金等收入超收較多。其中：三峽工程建設基金收入195.98億元，鐵路建設基金收入544.11億元，民航機場管理建設費收入114.99億元，港口建設費收入105.55億元，新增建設用地有償使用費收入274.94億元，大中型水庫移民后期扶持基金收入158.82億元，彩票公益金收入201.17億元等。加上2008年結轉收入574.58億元，使用的收入總量3082.25億元。中央政府性基金支出2426.54億元，完成預算的84.2%，下降3.2%，主要是部分新增建設用地有償使用費、大中型水庫移民后期扶持基金結轉下年使用。其中：三峽工程建設支出199.23億元，鐵路建設支出544.11億元，民航機場管理建設支出110.14億元，港口建設支出102.2億元，新增建設用地相關支出198.11億元，大中型水庫移民后期扶持支出151.14億元，彩票公益金用于社會福利、體育、教育等社會公益事業支出207.9億元等。中央政府性基金結轉下年支出655.71億元。
地方政府性基金本級收入15827.37億元。其中：國有土地使用權出讓收入（包括國有土地使用權出讓金收入、國有土地收益基金收入、農業土地開發資金收入和新增建設用地有償使用費收入）13964.76億元，彩票公益金收入211.75億元，城市基礎設施配套費收入336.60億元，地方教育附加收入178.44億元。地方政府性基金支出14291.55億元。其中:用國有土地使用權出讓收入安排的支出12327.1億元，包括征地拆遷補償以及補助征地農民支出5180.58億元、土地開發支出1429.71億元、農村基礎設施建設支出433.1億元、城市建設支出3340.99億元、土地整理和耕地開發支出477.56億元、土地出讓業務支出86.89億元、廉租住房以及破產或改制國有企業土地收入用于職工安置等支出1378.27億元。彩票公益金用于社會福利、體育、教育等社會公益事業支出231.47億元，城市基礎設施配套支出214.69億元，地方教育支出128.83億元。
政府性基金當年收入與支出不完全相等，主要原因是根據有關管理規定實行專款專用，部分收入結轉下年使用。
以上有關預算執行的具體情況詳見《中華人民共和國2009年全國預算執行情況2010年全國預算（草案）》。
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