提高企業自主創新能力，不斷強化企業在自主創新中的主體地位，是企業實現發展方式轉型、增強發展后勁、提高核心競爭力的重要舉措。
“十二五”時期是我國經濟社會發展的關鍵時期，也是提升企業國際競爭力、建設創新型國家的攻堅時期。當前，我國經濟總量、產業規模、企業數量已經較大，取得了很多世界第一，企業提升自主創新能力的勢頭較好，成效顯著，在工業發展重點領域、關鍵環節擁有了一批具有自主知識產權的核心技術和產品。但總體來看，企業的原始創新、集成創新、引進消化吸收再創新能力仍然比較薄弱。與發達國家相比，企業自主創新仍然面臨巨大挑戰，在技術創新中的主體地位尚未真正確立，企業的創新能力亟待提高。
從某種意義上說，中國要想立足世界，光靠做世界工廠是遠遠不夠的，必須要有一大批掌握新技術、具有核心競爭力、具備持續創新能力的創新型企業。尤其是在當前，短期的困難和長期的矛盾交織在一起，轉變發展方式、調整經濟結構的任務越來越艱巨，資源環境的制約越來越突出，國際經濟和科技競爭的壓力越來越大。在這種情況下，企業只有加快科技創新，才能從根本上克服國際金融危機帶來的不利影響。
面對異常嚴峻的外部環境，廣大企業既要有心理準備，也要有現實行動；既要認清形勢，也不必消極悲觀。要堅定不移地把自主創新和科技進步作為企業發展的首要推動力，通過原始創新、集成創新和引進消化吸收再創新，從根本上扭轉一些關鍵核心技術受制于人的局面，突破國外技術壟斷和知識產權壁壘，掌握一批具有自主知識產權的核心技術，努力爭取在一些重要行業和關鍵領域占據國際領先地位，從而提升企業核心競爭力。
具體而言，要做好以下幾方面工作：
第一，增強企業自主創新意識。增強企業自主創新意識是提升企業自主創新能力的前提。而加強企業文化建設則是增強企業自主創新意識的一個重要前提。一是突破不思進取、安于現狀等僵化和保守觀念的束縛，形成積極進取、勇于探索、鼓勵創新、寬容失敗、開放包容、追求卓越的企業創新文化；二是營造有利于創新人才成長和發揮作用的體制機制和環境，采取有利于創新人才成長的措施，形成尊重知識、尊重人才、尊重創造的企業創新文化。三是高度重視科技人才隊伍建設。要充分調動科研人員的積極性和創造性，打造一支層次分明、結構合理、素質高、能力強的創新人才梯隊；依托重點工程和重大科技專項，培養和造就一批能夠站在行業科技前沿、勇于開拓創新的各類領軍人才；通過校企合作、訂單式培養，加強一線創新人才、青年科技人才和高技能人才隊伍建設，特別要注重挖掘和培育復合型科技管理人才，為引領企業科技創新儲備力量。
第二，完善企業自主創新機制。完善的自主創新機制是提升企業自主創新能力的制度保障。一是健全企業自主創新的管理體制和治理機制。要健全和規范政府對企業的管理體制，減少政府部門對微觀經濟活動的直接干預；加快建立現代企業制度，完善公司治理結構，形成合理的法人治理結構。二是健全企業自主創新的激勵機制。企業應建立健全生產要素參與分配的長效激勵機制，以激發參與者的創新熱情。對通過高新技術企業認定、獲得發明專利、建立研發中心等創新活動，要給予獎勵和扶持，對有突出貢獻的科技人員和經營管理人員，可通過期權、技術入股、股權獎勵、分紅權等激勵形式，有效激活、釋放企業人員創新動力。三是健全企業自主創新的人才管理機制。要建立健全科學合理的人才管理機制，重視科技人才隊伍的培養。
第三，著力構建開放式技術創新體系。建立高效、協同、開放的技術創新體系，對企業技術創新能力的提升至關重要。企業要努力解決科技資源重復分散的現象，著力加強實驗室、中試基地等基礎條件平臺建設，打造一批世界一流的科研開發平臺。一是促使企業成為自主創新的主體。一方面，加大科技投入力度，建立有利于自主創新的內部技術開發機構，廣泛開展各種形式的自主創新活動，體現企業自主創新主體地位；另一方面，大力實施知識產權戰略和名牌戰略，力求掌握具有自主知識產權的關鍵技術，為經濟社會發展提供高科技成果和專利，進而開發更多的名牌產品，在市場競爭中占據主導地位。二是鼓勵企業與高校、科研院所形成創新聯合體。要發揮高校、科研院所的科技先導作用，鼓勵企業與高校、科研院所合作設立實驗室或研發機構，促進高校、科研院所技術人才和科技資源優勢與企業的資金、生產基地和市場網絡優勢的對接和互補，加快科技成果向生產力轉化的進程。
第四，全方位營造企業自主創新的良好環境。良好的企業自主創新環境是提升企業自主創新能力的必備條件。企業自主創新良好環境的形成，離不開政府制定并實施有利于自主創新的投資、財稅、金融、技術轉移等方面的政策。在金融支持方面，要通過完善相關金融政策，引導各類金融機構支持自主創新和科技成果的產業化，并為成長型中小企業融資提供良好條件，積極支持高新技術產業、自主創新企業的風險創業投資和發展多層次資本市場，拓寬創業風險投資進入和退出的各種渠道；在技術轉移支持方面，要發展各類科技中介服務機構，促進企業之間、企業與大學和科研院所之間的技術、知識的流動和轉移，加快科技成果轉移步伐。