6月2日，日本眾議院以293票對152票否決了自民黨等在野黨提出的對菅直人內閣的不信任案，從而避免了內閣集體辭職或解散眾議院重新舉行選舉的結局。回到首相官邸，菅直人總算松了一口氣，回答記者提問時稱結果“很好”。
自民黨等反對黨提出針對菅直人內閣的不信任案，主要理由是執政的民主黨在救災和重建兩方面都很不給力，而作為最高領導人，菅直人也未能發揮領袖作用。此外，到目前為止，福島第一核電站核泄漏事故尚未得到完全遏制。從民意角度看，日本國民普遍認為菅直人缺乏擔任首相的資質，日本經濟界首腦也認為應盡快換人。日本最大的報紙《讀賣新聞》評論說，自民黨此時提出針對菅直人內閣的不信任案“似乎可以理解”。
除了在野黨咄咄逼人，民主黨內部也出現分歧，小澤、鳩山兩派議員準備倒戈。幸虧菅直人在投票前及時與前首相鳩山由紀夫舉行會談，承諾在日本大地震災后重建、福島核電站泄漏事故處理告一段落后辭職，把位置讓給年輕人，才使一批民主黨議員改變立場，加上小澤一郎等人最終決定缺席，菅直人這才躲過一劫。
但日本大地震災后重建和福島核電站泄漏事故的處理工作又何時才算告一段落？到什么程度才算告一段落？這就要看菅直人如何進行解釋了。有分析指出，一直想在首相位置上堅持下去的菅直人不會輕易讓出位置，他或許希望隨著時間的推移，賑災和重建都有起色，從而扭轉民意，平息反對者的指責。但時間真能改變一切嗎？
盡管自民黨等在野黨先輸一陣，卻仍有后手，日本政壇未來注定不會平靜。日本國內觀察家指出，自民黨可能會在執行今年預算必須發行38萬億日元赤字國債的特例公債法案上作梗，還可能在參議院提出首相問責決議案，從而阻擊民主黨力推的二次補充預算和復興基本法。
目前，海嘯沖擊過的災區滿目瘡痍，10萬避難的災民有家難回。他們還在忍受失去親人和財產損失的痛苦，并且至今無法恢復正常生活。福島第一核電站核泄漏也仍在繼續，日本經濟在失去20年后遭受地震、海嘯、核泄漏三重打擊而陷入持續衰退。
很多日本人感慨，雖然早知日本政壇病了，但沒想到如此之大的天災也不能對其有所觸動。如果不能盡早結束政局動蕩，日本經濟只會衰退下去，災后重建停滯也就難以避免，債務大山也會越積越高。