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日本宮崎縣最近發生了口蹄疫疫情，這是時隔十年日本再次發生口蹄疫，和十年前不同的是，這次口蹄疫來勢兇猛，日本損失慘重。2000年3月至6月，北海道發生口蹄疫疫情，但僅出現三例牛感染口蹄疫病例，宰殺處理牛740頭，雖然也屬于O型病毒，但相對感染能力較弱，沒有在更大范圍內擴散。這次在宮崎縣發生的口蹄疫疫情，從4月20日確認第一例口蹄疫病例起，感染范圍擴大到近200家農場，截至6月8日已宰殺牛和豬16萬多頭，還有14萬頭等待宰殺。這次口蹄疫病毒也是O型病毒，但毒性較上次感染力要強得多。
日本專家認為，這次口蹄疫疫情兇猛的原因除了病毒本身感染能力強之外，與豬感染上了口蹄疫也有很大關系，上次北海道口蹄疫疫情沒有出現豬感染口蹄疫的狀況。宮崎縣宰殺的家畜中豬的頭數是牛的數倍，豬感染口蹄疫病毒易于擴散，試驗表明，口蹄疫病毒在豬體內增殖快。
這次口蹄疫對日本畜產業打擊沉重。首先，大量宰殺家畜，被稱為“畜產王國”的宮崎縣損失慘重。根據家畜傳染病預防法，為了防止疫情擴大，凡發生感染和疑似病例的農場，家畜要全部宰殺，現在擴而大之，以發生疫情的農場為半徑10公里以內的“移動限制區域”的家畜，全部成為宰殺對象。
其次，對日本的品牌牛是致命打擊。為了對抗外國牛肉的進口，日本不少地方都培育了自己的品牌牛，如三重縣的松阪牛、佐賀縣的佐賀牛、長野縣的信州牛等，這些品牌牛的子牛就來自宮崎縣。由于宮崎縣的子牛全部宰殺，對全國不少地方名牌牛造成了致命的打擊。
現在唯一的好消息是，被譽為“宮崎之寶”的正在避難的種牛還剩下五頭沒有感染口蹄疫，總算為宮崎縣振興畜產業留下希望，為全國的品牌牛留住了“根”。
再次，日本“和牛肉”出口全部停止。這次日本防止口蹄疫決心很大，為了防止疫情進一步擴散，日本決定對等待宰殺處理的家畜注射疫苗。
注射疫苗在貿易上多有不利，在國際上被認為“污染國”，肉食不能出口，日本的牛肉出口2006年為99噸，到2009年上升到676噸，在新加坡、加拿大富裕階層中很有人氣。
日本4月20日出現口蹄疫疫情后，牛肉出口基本停止，注射疫苗被認定為“污染國”之后，按照國際慣例，3個月內不發生新的疫情，才能返回到“干凈國”的行列，這樣，從“和牛肉”停止出口到再次出口需要半年的時間，如果再出現新疫情，出口“和牛肉”將變得遙遙無期，日本農業出口的重點項目受到了毀滅性的打擊。
這次日本防止口蹄疫蔓延有三大教訓：一是誤診。3月下旬，宮崎縣都農町就有牛拉痢疾，縣里的獸醫檢查沒有發現水皰和口涎，也沒發現導致痢疾的病毒和細菌，結果不了了之。4月9日相隔600米的農場有牛口腔出現潰瘍，另有一頭牛前一天有發燒現象，食欲不振，有少量口涎，但沒有發現水皰，因為水皰是口蹄疫的又一特征之一，因此，醫生沒有太當回事兒。4月16日，又發現兩頭牛有相同癥狀，19日衛生所檢查為陰性，和縣當局和政府部門聯絡之后，20日檢查呈陽性。從3月下旬出現病牛到4月20日確認口蹄疫疫情，耽誤了整整一個月的時間。前兩天廣島又有牛出現口腔潰瘍的現象，地方當局及早送權威單位檢疫，檢測結果呈陰性，虛驚一場，這說明日本人已接受了宮崎縣的教訓。
二是政府應對遲緩。4月20日確認口蹄疫疫情之后，并沒有引起政府足夠的重視，只是在農水省成立了口蹄疫對策總部，鳩山首相則被普天間機場遷址問題弄得焦頭爛額，農水大臣赤松廣隆在五一“黃金周”出訪美國，除了按家畜傳染病預防法的一些規定動作外，并沒有拿出更為有力的具體措施。到了5月17日，口蹄疫感染和疑似病例發展到120多例，出現失控的現象，政府才動真格的，成立了以鳩山首相為部長的口蹄疫對策總部，由于農水大臣赤松廣隆對應不力，這次在菅直人組閣時，11名原內閣成員留任，其中沒有赤松。
三是防控口蹄疫政府指導不力，疫區防疫缺乏必要的常識。如轉移“宮崎之寶”六頭種牛就是如此。4月20日發現牛感染口蹄疫疑似病例后，宮崎縣有關當局無論如何都要保護6頭主力種牛，作為特例，政府允許6頭主力種牛到區移動限制域外避難。5月13日，一頭名叫“忠富士”的種牛和其它5頭種牛開始轉移，但轉移之時沒有一一隔離。后來被確認感染口蹄疫的種牛“忠富士”當時可能體內已有口蹄疫病毒，卻與其它種牛同處一卡呆過很長時間。到達西都市臨時牛舍后，6頭牛約一周內同住一個牛舍，“忠富士”被確認感染口蹄疫之后，才與另外五頭種牛分開隔離，分別進行管理。幸虧這五頭種牛沒有被感染，否則宮城縣種牛將全軍覆沒。
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