“最后一公里”，在水利領域一般指的是小型農田水利。由于國家對“小農水”的投入少、欠賬多，加上農民缺乏投入能力和積極性，“最后一公里”的梗阻問題成為了制約農業發展的一大瓶頸。
中央一號文件提出未來10年全社會水利年平均投入比2010年高出一倍，而土地出讓收益中的10%將被用于農田水利建設。隨著水利投入的成倍增長并流向農村，“小農水”面臨著另外一個“最后一公里”問題：大量的資金如何能夠有效使用？
對于大中型水利工程的投資和建設，政府和企業都具有一定的積極性，投融資機制也比較成熟。而由于投資主體不明確、設施產權不明晰、用水制度不完善和管護編修機制不健全等問題，“小農水”的建設顯得復雜許多。
農村改革之前，農田水利的投入基本是依靠農民投工投勞。實行“大包干”之后，土地、勞動力和資金大量地從農村流出。很長一段時間里，“小農水”成了被遺忘的角落：政府公共財政退出農村基礎設施建設，農村勞動力大量外出務工，企業更是沒有興趣進行投資。農民往往只能通過自己購買小型水利設施和打機井等方式，來滿足農業生產的用水需求。
近年來，隨著中央推動資源要素向農村配置，加大對“三農”的投入(包括對農田水利的投入)，新的問題產生了。比如，作為替代“兩工制度”的“一事一議”方式遭到質疑，有學者認為這種籌資籌勞政策在執行過程中，存在交易成本大、達成協議難和監督成本高等諸多問題。
早在2009年，全國人大調研組關于農田水利建設項目實施情況的調研報告也指出，由于投入渠道分散，運行環節繁多，造成農田水利建設資金難以形成合力，不利于按照統一規劃進行實施，項目監督和評估難度加大，行政成本增加，重復建設和管理主體缺位的情形并存。
也就是說，小農經濟在面對大規模資金進入時，需要有與之相適應的農村組織結構和動員體制，從而確保資金的有效使用，并最終確保農民受益和農業、農村發展。
按照中央一號文件的精神，農田水利投入將形成以財政資金作為主導、充分調動廣大農民積極性和社會投入的機制。在這樣的“新機制”里，最核心的部分可能不是財政資金，而是農民的主體地位。如果忽視了農民對于農田水利項目的知情權和參與權，不尊重農民的意愿，一味“自上而下”地搞水利建設，只會催生一個又一個“政績工程”。
當然，發揮農民的主體性不是一句空洞的口號，而是要明確國家、集體和農民的責任和權利。比如深化小型農田水利產權制度改革，大力扶持以農民用水戶協會為主的農民用水合作組織，調動農民用水、管水和加強水利設施維護的積極性，加強公益性的基層水利管理機構和技術服務組織建設等。